厦门远海码头将首先试行全自动化码头。实施码头自动化，对提升码头整体作业效率，提高设备利用率，降低操作运行成本，有效提升竞争力具有重要意义。
自2012年4月7日，中远集团、厦门市政府和中交集团于北京召开厦门远海全自动化码头专题会议以来，经各方积极协调，厦门远海全自动化集装箱码头改造示范工程(一期)项目于2012年10月27日签署三方(厦门海投、上海振华、中远太平洋)技术框架协议。基建工程部分已完成改造工程工可编制和确定改造技术方案，进入施工图设计阶段。现场施工已按照自动化码头平面布置方案进行改造部分区域施工方案变更。自动化码头建成后，相关泊位工程的设计吞吐量将可在原设计能力的基础上增加20%—40%。