生物芯片仪器作为生命科学研究尤其是生物芯片技术的支撑平台，广泛应用于分子生物学、医学基础研究、疾病基因诊断、临床治疗、药物开发、农作物优育和优选、环境检测和防治、食品卫生监督、司法鉴定和生物武器等领域。对促进当代生命科学的发展，使人类认识世界与改造世界的能力可实现新的飞跃。
中国科学院光电技术研究所瞄准国际最新发展趋势，在中国科学院知识创新工程的支持下，作为中国科学院知识创新工程重大项目，在国内创新开展了激光共聚焦生物芯片扫描仪、CCD生物芯片检测仪等多项生物芯片检测前沿技术产品的研发工作，先后取得了多项创新成果和专利。
CCD生物芯片检测仪采用蝇眼透镜均匀照明技术和冷光照明技术，实现±3%均匀照明。解决了多波长激发光源均匀照明技术问题；采用大数值孔径物镜高效率地收集荧光信号，利用合理设计的窄带滤光片尽量消除激发光和CCD探测发射荧光时杂散光的影响，并极大地减小光源激发和发射荧光之间的交叉耦合，选用12位冷却型科学零级CCD进行探测，以提高探测灵敏度和动态范围。实现了图像处理过程中的图像平滑、图像去噪声、图像锐化等滤波算法，以进一步提高探测结果的信噪比，并通过信号光斑自动定位和背景噪声自动识别等专门算法，保证图像分析结果的准确性。
2004年由中国科学院主持的生物芯片仪器研制技术鉴定会上，国内知名专家对项目的研发成果和完成情况给予了充分的肯定及高度评价。专家们认为，光电技术研究所目前已建立了包括设计、制造工艺、产品检测与应用为一体的生物芯片仪器技术平台，是目前国内研制生物检测仪器种类最全、品种最多的研发单位，该项目研制的三类生物芯片仪器整体水平步入国际先进行列，其研制成果对人类基因研究、人类健康和疾病研究、促进中国生命科学的发展具有重要意义，具有广阔的市场和应用前景。