大连海关采取多种措施，积极促进环渤海区域开展内外贸集装箱同船运输。
随着国内港口集装箱运输业的发展，各港口城市、港务部门、内支线船舶运营人等对内外贸集装箱货物同船运输（以下简称“内外贸同船”）的呼声越来越高。大连海关充分认识到促进此项业务的开展有助于提高航线的利用率、降低
物流运输成本，有助于优化国内集装箱班轮航线的布局，他们在进行充分调研和分析的基础上，决定在环渤海内支线上开展内外贸同船运输。
大连海关先是与沈阳海关签署了《大连海关、沈阳海关关于内支线同船运载内、外贸集装箱货物监管联系配合办法》。此外，大连海关还按照“主动适应、扎实工作、改革创新、全力服务、立足关区、面向全省、服务东北、辐射全国”的思路，主动牵头协调东北及内蒙古地区６个直属海关联手合作支持东北老工业基地振兴，充分发挥大连口岸的辐射作用。
为了使此项业务能够在环渤海湾地区进一步开展，大连海关还主动与石家庄、青岛海关进行沟通交流。２００５年，大连海关将重点加大对此种监管模式的宣传，为企业提供便利；完善现有模式，促进内支线同船运输利用率的提高；加强联系协作，实现大连海关与所有环渤海湾海关的联手合作，共同促进内外贸同船业务的开展。